惟神开辟以来，钟弒灵秀，磅磚江东，然而气运凝会，人英能知。余自乙未渡江，丙申驻师金玫，抚安黎庶，于今十有二年。拓土广韁，神人翊赞。兹欲立郊庙社稷、建殿宇于旧城之东，钟山之阳。国祚绵长，惟山川气运是从。谨于是日肇庀工事。底拜敬告于山川神灵。
祭典完毕，朱元璋挥锹破土，为皇宫奠基。
可是，正殿殿基选定后，朱元璋却嫌前面地势不够开阔，吩咐将放线桩向后移动了三四丈，然后问刘伯温：“伯温先生，你看，这样使得吗？”
刘伯温无可奈何地说道：“既已移动，只好如此。”
“怎么？莫非有什么不妥之处？”朱元璋十分诧异。
“这……”刘伯温欲言又止。
“军师不必吞吞吐吐，有话不妨直言相告嘛刘伯温迟疑地答道：“只恐……尔后有迁都的可能。”
“嘿，那倒不怕。收复中原后，宥了更符合心意的风水宝地，何妨迁到新址！”
刘伯温无言以对。
外城、皇城全部修好后，刘伯温陪朱元璋迸行查看。城墙青砖白缝，巍然高峻，朱元璋十分高兴，指着女儿墙笑道：
“哈哈，城墙如此高峻，尔后无人能够越过！”
刘伯温随口答道：“是的，除非燕子能够飞过。”
这些不经意的随口之谈，等到燕王朱棣夺取皇位，成为永乐皇帝，定都北平。人们竟附会成早在三十年前，刘伯温就有“迁都”和“燕子飞过”的先见之明。使刘伯温的头顶上，又增加了几道智慧的光环。但也可以看出，朱元璋对风水气运是何等看重，何等战战兢兢。
张士诚灭亡之日，正是应天宫殿落成之时。时间上的巧合，仿佛是天意的安排。朱元璋兴奋不已，暗暗叨念：“苍天神佛佑我，大吉大利，诸事顺遂也！”
新落成的建筑，比之历代帝王的皇城宫殿，更加巍峨宏大，气魄非凡。皇城设四门：南面是午门，东面是东华门，西面是西华门，北面是玄武门。
宫殿的正门是奉天门。进了奉天门，是三大殿：迎面是奉天殿，迤后是华盖殿，再往后是谨身殿。这是未来新皇帝临朝问政的地方。奉天殿的左右各建一楼，左曰文楼，右曰武楼。谨身殿之后是后宫，依次为乾清、坤宁、懿安三大宫。另外六宫，排列其后，是后妃媵嫱的住所。
历朝宫殿内墙的布置，飞金点翠，彩绘满壁。不是描绘龙凤飞舞，就是状写帝王巡狩。朱元璋一改旧例，“不要那些劳什子”。他让博士熊鼎精心摘编出一部“语录”，都是些可资鉴戒的古人懿行嘉言，书于殿壁之上。
两侧则书写宋人真德秀论修身、齐家、治国之道的《大学衍义》，表示他孜孜求治的意愿和决心。
有了崭新的皇城和宫殿，新王朝要取代旧王朝，还要有全新的礼仪、历法和法律。元人的许多礼法、律令，必须做重大的修改，甚至全部摒弃。恢复与圣贤礼仪相吻合的庸宋旧制，以便让新皇帝以全新的面貌，隆重登基，君临天下。
在大兴土木的同时，便建立了相应的办事机构：负责制定礼仪的翰林院和太常寺，负责修订历法的太史院，负责制定和执行法律的御史台。有衙门就得有官吏，起居注宋濂，此时已回金华省亲，任命陶安为翰林院学士，兼任礼仪总裁官。刘基为太史院使，着手制定新朝“皇历”。汤和为御史台左御史大夫，邓愈为右御史大夫。刘基、章溢为御史中丞。在此之前，沿袭元朝制度，百官礼仪尚右，这时改为尚左。将第一相国、右相国李善长改为左相国，封宣国公，左相国徐达则改为右相国，封信国公。又召来精通音律的道士冷谦，为太常寺协律郎，负责考订庙堂雅乐，监督制造编钟、编磬，校定音律，编订乐舞。命左相国李善长为律令总裁官。参知政事杨宪、傅愷、御史中丞刘基、翰林学士陶安等为议律官，参人编制法律。
新朝甫立，百废待兴。朱元璋不惮劳剧，事必躬亲。各衙门呈送来的草案，他都亲自审阅，进行修订。朱元璋对改制仪礼和修订律令尤其关心。这位文化不高的最高当权者，对法律的要求是浅显简约。为迎合朱元璋的。味，李善长特意强调说：
“立法贵在简约，使人易知易晓。如果头绪繁多，或者模棱两可、可轻可重，猾吏便会投机为奸，使本来禁止残暴的条文，变成残害善良的绳索，那就远离了制定法律的本意。要知道，鱼网密，则无大鱼法网密，则无全民。你们要细心参度我的意思。”
在李善长的亲自督促和指挥下，朱元璋所关注的一切，都紧锣密鼓地加紧执行，很快便相继完成。
万事俱备，只欠东风。散发着浓烈油漆气味的金銮宝殿，珠光宝气，流光溢彩，只等待真龙天子升阶人座了。
朱元璋的心头，何尝不是骚痒难耐！趁着别人不在意，他迫不及待地坐到了那把金龙环绕的高背龙墩上。出乎意料的是，这一坐，差一点搭上一—条无辜的人命。
]了让未来的真龙天子处处满意，在皇城宫殿就绪之后，施工总指挥刘基陪同朱元璋，四处查看。发现有不满意的地方，立即进行修改，力求做到一切完美无缺。
两人在午门外下马。朱元璋仰望着飞檐斗拱的两层城门楼，脸上露出了满意的笑容。缓步踱进午门，他一面仔细察看，一面跟身边的刘伯温，谈论着自己的观感。为了谈话方便，朱元璋让亲兵把守在奉天门口，只跟刘伯温往奉天殿走去。
奉天殿一横九楹，矗立在光洁的汉白玉座基上。玉栏蹲兽，黄瓦耀金，朱柱喷火，飞檐摩天……端的是巍蛾壮丽、令人叹赏！
“叮叮咚咚——”一阵清脆悦耳的声音，自头顶上方传来，仿佛是天宫飘来的仙乐。寻声望去，原来是淸风拂动檐铃发出的阵阵轻响。几只白羽毛的飞鸟，从宫殿的上方，自南向北悠然飞去，一面嘹亮地鸣啼着。像是在昭告天下，金陵落成了一座崭新的宫殿，一个替天行道的新皇帝就要在这里登基……
出生于低矮茅草屋子里的放牛娃，受尽歧视的捧钵穷和尚，就要成为这座宫殿的主人了！
是真耶，是梦耶？宛如喝多了醇酒，朱元璋心头畅快，脚下轻捷，仿佛就要飞升天界……
“哎呦！”由于贪看周围的一切，朱元璋被脚下的石阶绊了一个趔趄。“大王，当心呀！”比朱元璋年长十七岁的刘伯温，急忙伸手搀扶。
“没关系——咱摔不倒。”朱元璋急忙收回悠悠遐想。
走进了奉天殿。粉白的大殿四壁上，题写着历代帝王圣贤的嘉言诫语。真、草、隶、篆、行五体皆备。朱元璋虽然自己写不出好字，但能看出，篇篇题字都极具功力。题写者有李善长、宋濂、陶安、章溢，也有本城的知名书法家。内容早经自己审阅，自然提不出什么意见。但其中几幅篆字，朱元璋看了许久，仍然认不得几个，摇头说道：
“这几幅弯弯曲曲的，看着像画不像字，也不知道写的是什么。叫武将们怎么看得懂？千脆统统刷了去，换成别的字体吧。”
“遵命。”刘伯温一面答应着，转身要走，“我这就去吩咐，找人另写。”“慢！”朱元璋把他喊住了，“这上面，为何没见老先生的大手笔呢？”“大王，微臣字迹丑陋，恐怕有污龙……”“目”字没出口，刘伯温自知失言。还没登基成“龙”，便称“龙目”，不合时宜。急忙改口道：“恐怕有污大王清目。”
“老先生过谦了。堂堂进士，焉有字丑之理？我要是……”朱元璋想说我要是能写出你那一笔字，就心满意足了，忽然想到有失身份。轻咳一声，指着眼前的一幅宇掩饰道：“我要是一定要求老先生的大手笔呢？”“臣不敢不从命。不过，还是另请名家为好。”
“那也好。”朱元球点头应允。
刘基匆忙说道：“大王慢慢察看，微臣去去就回。”
刘基快步出殿去了。朱元璋的目光停到了大殿中央屏风前的御坛上。御坛中央，一把金光闪闪的盘龙椅，已经安放停当。看样子只等着万岁爷在群臣的欢呼声中，款步就座了。他快步登上御坛，一扭屁股坐了上去。两手抓着扶手，双脚前伸，身子朝后一仰，发出一声浩叹：
“啊！我朱元璋终于盼来了这一天！往后，我要天天坐在这里，发问降旨，替天驭……”
谁知“民”字还没出口，忽然传来一声轻轻的咳嗽声。紧接着，一个沾满金黄油漆的毛刷子，“噗”地落到脚下，差一点砸到了他的头上。朱元璋不由一惊，急忙站起来四处张望。原来，头顶上方的横梁上，蹲着一个年轻的工匠。手里提着个油漆桶，面色蜡黄，瑟瑟抖个不止。不用说，刚才自己说的话，都被这工匠听了去。自己的内心秘密，岂能让别人偷听！朱元璋大怒，正要喊人来将工匠捆起来问罪，忽然又把话收了回去。那样一来，岂不是把刚才的一切，都“审”了出去？是的，还是暗暗处理掉的好！他狠狠朝上瞥一眼，大步走出了大殿后门。
刘伯温返回奉天殿，不见了朱元璋。正要四处寻觅，一个满脸惶恐的年轻油漆匠，不知从什么地方闪了出来，来到他的面前。刘伯温经常来检查工程进展情况，这人看上去有些面熟。
“咦？吴王驾到，你怎么不回避，还敢留在这里呢？”刘伯温不解地问。
丁。匠颤颤抖抖地答道：“大人，头儿嫌横梁上的金漆刷得不习，逼着返工。俺正在刷着，不想，吴王就走进来啦。”
“吴王看到你了吗？”
“看到了。吴王说的话俺也听见了。俺吓得掉了刷子，差一点打到吴王的头上。”
“你听到吴王说什么了？”
年轻人详细说了刚才看到、听到的一切。刘伯温突地变了脸：“年轻人，你惹了大祸！”
“可不是吗——淹也见吴王脸色不好，怕是生了气。大人，吴王能处置俺吗？”
“仅仅是处簠就好了。唉，唉！”刘伯温深知朱元璋的脾气。双眉紧蹙，连声长叹。
“大人，你老人家救救俺吧。俺不能死，俺家里还有个古稀老娘呀！”油漆匠跪到地上大哭起来。
“墟——别出声。快起来，听我告诉你怎么做。”刘伯温想出了主意。他把年轻人拉到盘龙柱后，低声嘱咐了一阵子，然后叮咛道：“记住，一定照我的吩咐做！”
朱元璋返回后，脸色轻松了许多。看来，油漆匠的事，并没有破坏他的好心情。他向刘伯温调侃道：“中丞忙什么去了，这么长时间不见人？”“不瞒大王，近几天微臣闹肚子。”
“怪不得！”朱元璋朝梁头上瞥一眼，指着问道，“这混蛋怎么还不滚？”
“哎呦呦，怎么上面有个人？”刘伯温抬头望着梁头，惊讶地喊起来，“大胆！赶快下来，滚到一边去！喂，你听到了没有呀？下来，快下来呀！”
油漆匠分明没听到，照旧不紧不慢地刷着油漆。刘伯温扭头说道；“大王，原来是个聋子。”
“会吗？”朱元琢眨眨眼，“我看着不像。”
“大王，不妨让他下来，当面问个明白。”
刘伯温拍柱子，跺脚，忙活了好一阵子，油漆匠方才发现有人喊自己。他慢慢从屏风后的梯子上爬下来，来到他们的跟前，一面作出刷油漆的动作，一面“哇，哇，哇”地乱叫。
“哈哈哈！”刘伯温仰头大笑，“我只道是个聋子，原来还是个哑巴！俗话说，十哑九聋——果然不差。”
朱元璋又问了几句话，年轻人仍然胡乱哇啦，方才确信这个浑身沾满油漆的家伙，不是假装哑巴。刚刚抬脚要走，突然转身回来，朝着油漆匠的大腿上，狠狠就是一脚。油漆匠被踢出去足有一丈远，狠狠地摔到了地上。
朱元璋仍然不解恨，厉声骂道：“混蛋！我的好心情，差点让你给搅了！看在你是个哑巴的份上，就饶了你这一回！”
无辜的油漆匠，在刘伯温的帮助下，终于躲过了一场大祸。他在朱元璋勃勃兴头上洒的几滴冷水，也很快化成烟雾，飘散而去。
朱元璋的“好心情”，确实没有被搅。前方战事，已成摧枯拉朽之势，雪片似的捷报，更使他处于亢奋之中。他准备南北同时用兵，早日平定全国。
踞苏湖一带的张士诚被彻底消灭后，据守福建的方国珍便失去了屏障。朱家军三面逼近，形势十分危急。
攻下婺州后，朱元璋曾与方国珍达成妥协，两家各守边界，互不侵扰。但方国珍在与朱元球通好的同时，又接受元朝的封号。每年拨出海船，将张士诚纳贡的十几万石漕粮运向大都。朱元璋多次致书，劝方国珍不要脚踏两只船，无奈方国珍置若罔闻。至正二十二年，金华蒋英等叛乱，杀了胡大海，提着人头前去投奔，方国珍害怕得罪朱元璋不敢接纳。他的弟弟方国璋，在台州与蒋英的部队遭遇，战败被杀。朱元璋得知后，曾派人前去吊祭。第二年，参军胡深攻下瑞安，乘胜向温州推进。方国珍感到威胁，再次派使者求饶，许诺每年供奉白银三万两，一旦朱家军攻破杭州，便将温州、台州、庆元三郡，献给朱元璋。
可是，等到朱元璋攻克了杭州，方国珍不但不履约，反而与元朝王保保，及福建的陈友定相互勾结，妄图互为策应，保地偏安。朱元璋写信开列十二条罪状，命他悬崖勒马，每年纳贡二十三万石粮食，方国珍依然置之不理。朱元璋大怒，发出了最后通牒：
汝初纳款，谓杭州克，即献土来归。岂意汝怀奸挟诈，阳降阴板。张士诚与尔壤地相接，取尔甚易，其所以不敢加兵于尔者，诚以吾力能制之，尔故得以安处海阑，坐享三郡之福。尔乃身为不祥，背信弃义，时遣奸细窺我动錚，潜结陈友定以图相援彼自救不暇，何睱救人？尔何惑之甚也！今明以告尔：吾师下姑苏，南取溫、台、庆元，水陆并进，无能御也。若早于此时改过效顺，尽以小事大之义，犹可保尔富责，以遺子孙，以及下人。如其不然，集三郡之兵与吾较一胜负，亦大丈夫之所为。更不然，扬帆乘舟，帘入海岛。然吾恐子女玉帛反为尔累，舟中自生敌国，徒为豪杰所笑也。非分之恩，不可数得，尔宜慎思之。
方国珍召集弟侄及将领商议对策，多数将领心存侥幸，认为张士诚尚在支撑，自己地连东海，有舟船连接，朱元璋莫可奈何。于是，便将珍宝细软悉数搬到大船上，准备万一抵抗4、住时，便逃往大海躲避。
方国珍执迷不悟，只有兵戎相见。吴元年（1367）九月初一，苏州尚未拿下，朱元璋便派参政朱亮祖率衢州、金华等地驻军，讨伐方国珍。
出兵前，朱元璋向朱亮祖交代：“方国珍乃鱼盐贩子出身，懒惰偷生，骑墙观望。出兵征讨，胜利在握。那厮没有妙招，只有泛海逃遁一条路。你要尽量截断他的逃路。三州之民，疲困已甚，城破之日，毋妄杀一人。”果不出朱元璋之所料，方国珍的部队毫无斗志。朱亮祖几乎兵不血刃，就攻克了台州。方国珍的弟弟方国瑛弃城而逃，直奔黄岩。朱亮祖紧追不舍。方国瑛将黄岩官廨民居一火焚之，仓皇逃向大海。
苏湖战役结束后，部队稍作休整。十月十一日，朱元璋又派中书平章汤和为征南将军，都督佥事吴祯为副将军，与朱亮祖南北夹攻，夺取方国珍的巢穴庆元路。朱亮祖的部队，由台州、黄岩南下，一路势如破竹，很快拿下温州。十一月初，与征南副将军吴祯联手，在乐淸县盘屿水域，大败方国珍之子方明善的海上水师。紧接着，方国珍的老巢庆元落入汤和手中，方国珍率船队逃向大海。朱元璋立即增派著名水师统帅廖永忠为征南副将军，会同汤和人海追讨方国珍。
粜穴倾覆，树倒猢狲散。汤和采取招降攻心战术，方部许多将领纷纷率队来降。眨眼之间，方国珍成了孤家寡人。但历经几十年的磨炼，方国珍也练出了一套投机自保的本领，像个掉进油篓的鸡蛋——又圆又滑。在汤和大军抵达庆元时，他跟弟弟方国瑛不同，没作大的抵抗，也没有破坏城池。而是封闭府库，将一座完整的城市留给了汤和，他自己则率领部属，装载着宝物，向海上逃逸，但汤和紧追不舍。后来，方国珍看看实在逃不脱，只得率子侄部下向汤和投降，同时派儿子方明完奉表去应天，向朱元璋谢罪请降。《谢罪表》写道：
