晋元兴四年，临海郭澄之攻击会稽郡始丰，在天台山下与扬州司马刘裕激战，由于刘裕兵粮缺乏，武器也陈旧，一时大败，死伤者不计其数，刘裕收缩兵力于山阴转进攻于防御。郭澄之军也没有讨到便宜，面对刘裕的积极防御，也不得不撤军。
此役之后，卢循和刘裕双方再没有发生大规模的冲突，只是互相派遣小股军队进行试探性攻击。刘裕因此喘过了一口气，急忙向晋庭索要物资粮草，并以会稽郡诸事操作不便为由，要求晋庭任命刘裕为会稽太守。
由于攻击受阻，晋庭无奈，只得任命刘裕为会稽太守，辛景调往建康。但是并不增派兵力给刘裕，会稽郡的战事一时僵持了下来。刘裕这一路攻击受阻，其他二路进攻大军只不过是做做样子，自然而然也不得不停顿了下来。
晋庭与盘踞在武夷山以南的卢循军只得以武夷山为界，双方暂时停止了大规模的军事冲突。这给了卢循一个喘息的时间，他抓紧时间发展生产训练部队，同时打造兵器战船准备下一次与晋庭的冲突。
经过几个月的学习，政校和军校的第一批学员已经被派往靠近卢循根据地的晋庭实际控制的农村地区，卢循的意图是以建安等地为依托，慢慢向外面发展，不断蚕食晋国的地盘。这些人以土匪山贼水贼为形式四处偷袭晋国军营，同时劫杀士族地主，把土地分给周围的农民，得到了他们的支持，晋国控制地区渐渐燃起了一团熊熊的战火。
即便如此，晋庭中也没有几个人意识到问题的严重，只是把他们当成非常平常的农民起义罢了，这在当时的中国大地上是四处发生的。所以晋庭的高级士族们也没有把这些此起彼伏发生的农民暴乱当一回事，只是命令当地的郡县进行镇压罢了。
由于与卢循相邻的各州郡都发生了大小不一的农民暴动，各地郡府兵镇压都来不及，更妄说怎么计划进攻卢循所控制下的建安和晋安等四郡了。与以前他们所遇到的农民暴动不同，这些起义显然是有组织有目的的，而且由于把地方上的土地分配给了农民，所以这些如雨后春笋般涌现出来的起事政权非但没有被扑灭，反而愈演愈烈了。
这些农民起义机构一旦稳固下来，就立刻与卢循建立起了稳固的多方面联系，各地的优秀人才被派往建安府的勤政学校和政校进行学习，学成归来后被派往四郡以及他们原来所来的地方担任地方官员。
在经济上，由于实行耕者有其田，农民投入生产的热情高涨，又由于中央四郡向这些地方推广一些新的耕作方式和农田水利工具，所以虽然某些地方人丁虽然稀少，但是依然取得了非常显著的农业丰收。
各地的农产品通过大量的商人被运往了四郡以及夷洲各地，各地的物资也运往了各地，这些地方也越来越活跃了。
晋庭中间也有人把这些事情看在了眼里，比如说现在的会稽郡太守刘裕。卢循表现得这么明显，自然有很多人知道这些农民起义是卢循搞的鬼，但是他们都没有把卢循的这些动作看在眼里，因为他们认为把土地分给农民只会引得天下士族的怨恨，使他们合力对卢循开展攻击。到时候就是建康不动手，卢循也是死路一条了。
可是刘裕不这么认为。他是贫寒出身，自然知道土地对于农民是多么的重要了。有了土地的他们为了保护自己的土地会不惜一切代价和那些要抢夺他们土地的人拼命的，他知道这些发狂的农民的厉害，更知道卢循这种做法的厉害。
他也有意按照卢循的方式在会稽郡进行土地改革，但是奈何以孔靖为首的会稽地方豪族对于这项制度极力发对，因为这样一来就会侵害他们的根本利益，所以刘裕也只能无奈地放弃了。
虽然在土地改革上受挫，但是刘裕严明地方法令，对那些恃强凌弱的地方豪族杀一儆百，废除一些冗杂的制度和人事，并力减农户的负担，使得会稽郡的气象顿时一新。虽然不及卢循控制下的四郡，但是比起晋国的其他地方是好了很多。
刘裕一边整顿吏治大力发展生产训练兵员，一边暗自积蓄力量，加强与分散到了其他地方的那些老部下以及晋庭内部反对恒玄的势力的联系，在京师安插势力，准备在时机成熟的时候起事。
随着各方的动作，一时间形势云谲波诡，整个晋国都弥漫着一股山雨欲来风满楼的感觉，几乎所有比较敏感的人都已经注意到了这一股形势，只是作为晋庭实际上的最高掌权人的恒玄却没有意识到这一股态势。他依然在做着他的“皇帝”梦。
晋元兴五年秋，晋安帝司马德宗改元义熙，是为义熙元年（公元四百零六年）。在这个时候改元自然是为了图一个好兆头，但是在建康的大将军府中的晋侍中殷仲文显然不想让晋安帝和晋朝庭能够有一个好日子过。
“南郡公，现在司马氏已经失去威望，令天下人耻笑了，您出身名门望族德高望重，又身负显赫战功，这个时候您应该站出来挑起这副重担，取代司马氏，平定天下的人心惶惶之势。”殷仲文向恒玄劝说道。
“南郡公，殷大人说得很对，现在正是大好时间，天下人心未定，若是南郡公站出来取代司马氏掌控天下，天下人一定会信服的。况且司马德宗也已经准备进行禅让了，您应该尽快做好准备了。”散骑常侍卞范之也跟着道。
恒玄低头思考不语，但是脑袋也微微点了点，像是同意了二人的说法。卞范之和殷仲文互相对视一眼，他们知道恒玄已经被说动了，于是接着说道：“恒谦大人已经为您写好了‘家授九锡’和‘禅让’的文告了，只等着您同意，我们这就送往司马德宗那。只要大印一盖，同时召告天下，您就是天下新的主人了。”
这些人的准备都已经做到这个地步了，恒玄恍惚下定了决心道：“仲文，你立即草拟一道诏书，任命恒谦为侍中、开府、录尚书事；王谧为中书监、司徒；恒胤为中书令；加授恒脩为抚军大将军。”
“是，我这就去办。”殷仲文喜道。他是恒玄的姐夫，现在恒玄就要称帝了，对他这个拥戴有功的小舅子来说无疑是一件非常值得祝贺的消息。他与卞范之对视一眼，然后向后退了几步，走出了恒玄和卞范之所在的房间。
九月十六日，晋安帝司马德宗再次下诏：擢升为相国，总管文武百官，封楚王，采邑十个郡，加授九锡，楚国设置丞相以下文武百官。同时由于荆州刺史恒伟离世，诏命恒石康接任荆州刺史一职。
恒石康是前梁州刺史恒慾的儿子，也是恒玄和恒谦的堂弟。对于人臣来说，加授九锡和封王已经是所能够达到的最高目标了。现在恒玄一次性就越过了九锡和封王这两道坎，已经没有任何人能够阻挡他的步伐，那么他的下一步就是至高的位置——皇帝。
一时间朝野震动，大家都已经知道了恒玄的下一步动作了。远在数千里之外的卢循把郭澄之所呈上的信件仍在床几上，因为他的到来，导致恒玄的动作缓慢了下来，原本应该在三年前就应该发生的篡晋活动，硬是到了现在才开始。
只是历史的车轮是谁都无法阻挡的，恒玄已经用他的行为召告天下：他要篡夺司马氏的皇位了。
