4月9日，美英联军攻入巴格达，伊拉克人走上街头，欢呼解放。在美军的帮助下，巴格达广场上萨达姆的巨大雕像被推翻，标志着萨达姆政权正式垮台。
但战斗并未结束，萨达姆依然不知下落，伊拉克抵抗力量的意志还在。此后，美军的一个重要任务，便是搜捕萨达姆。
6月18日晚美国政府官员宣布，美军当天逮捕了萨达姆的高级秘书阿比德·哈米德·马哈茂德。此人在美军“扑克牌通缉令”中排名第4位-方片A，仅仅位于萨达姆、萨达姆的两个儿子库塞和乌代之后。马哈茂德落网让美军兴奋不已，因为美国情报部门认为，他是目前世界上最有可能知道萨达姆下落的人，“能否找到萨达姆全靠他了”！
现年46岁的阿比德·哈米德·马哈茂德是萨达姆的远房堂弟，与萨达姆政权其他高官一样，他也来自萨达姆的家乡提克里特。按照美军中央司令部的说法，马哈茂德是“萨达姆的国家安全事务助理和高级保镖”。
马哈茂德的仕途刚刚开始时还只是萨达姆私人保镖卫队中一个普通官员，后来萨达姆将他挑选出来当他的高级助手，随即被提拔为中将。在20世纪90年代，马哈茂德同时担任好几个安全部长职位，其职责中包括负责武器研发工作。因此他非常熟悉萨达姆的个人安全安排以及生化核武器项目情况。据《华盛顿邮报》称，他“被看做是萨达姆政权中真正的第二号人物”，比乌代拥有更高的权力。作为萨达姆总统的高级秘书，马哈茂德是少数几个得到了萨达姆完全信任的人之一。在美国情报部门掌握的照片中，可以看到他频繁地出现在萨达姆身边。而作为国家安全事务助理，他可以接触绝大多数伊拉克政府的机密文件，其中包括武器计划文件。在伊拉克，任何外交官、媒体甚至是医生想见萨达姆都要经过马哈茂德的详细审查。世界上只有萨达姆的儿子乌代和库赛两人，可以不必通过马哈茂德直接见到萨达姆。
紧接着，美军又于15日展开了“沙漠蝎子”行动，目的是查处伊拉克境内的违禁武器，并且打击亲萨达姆的残余武装力量。此次行动的主要区域，被美军称为“逊尼三角”，即伊拉克的中部、西部区域的几个城市，这里的居民对萨达姆政府的忠诚度很高，萨达姆的老家提克里特镇就位于这个三角地带的北部。
当然，无论是“沙漠蝎子”还是“半岛突袭”，这些大规模“扫荡”活动还有一个重要目的，就是多方搜集情报，力求尽快找到萨达姆和他的俩儿子的下落。
尽管没有确凿证据可以表明他们三人在战争中幸免于难，但美国国防部一名官员表示，情报分析家倾向于相信这三人目前仍然活着。
萨达姆的生死不明与伊拉克连续发生的袭击美军行动之间存在某种必然关系。“萨达姆仍然活着”是激励大量武装分子不断同美军“叫板”的精神动力。对此，白宫称，要揭开这位前总统的下落之谜至少需要几个月甚至一年时间。同时，美国在审讯伊拉克高层官员上并不顺利。美官员表示，对方受到过良好的训练，具有高超的反审讯技巧：他们要么供出一大堆美方早已知晓的东西，要么对某个明确的问题答非所问，即使对他们使用“强迫手段”，也很难从他们嘴里榨出有价值的东西来。不过，美军还是想尽办法，从萨达姆最信任的马哈茂德口中得到了萨达姆的重要情报，这为几个月后活捉萨达姆提供了基础。
“我们可以肯定，乌代和库赛已经被打死。”2003年7月22日，美军中央司令部的里卡多·桑切斯中将在巴格达举行的新闻发布会上对外宣布了这一消息。
7月21日，200余名全副武装的美军士兵在武装直升机的掩护下袭击了位于伊拉克北部城市摩苏尔的一处别墅。在激烈的交火中，萨达姆的两个儿子乌代和库赛被打死。据桑切斯中将介绍，驻伊美军在21日晚接到举报，称萨达姆的两个儿子乌代和库赛正藏匿在摩苏尔北部法拉赫区的一座别墅之中。获悉这一重要情报，美军第101空中突击师立刻展开行动。一小队美军士兵于当天晚上9时左右来到这座别墅，要求进行搜查，但遭到拒绝。这群美军士兵离开1小时后，近200名全副武装的美军士兵在25辆汽车的掩护下迅速包围了这处别墅。美军士兵向别墅逼近时遭到抵抗，楼内有人用轻型武器攻击美军。美军随即用机关枪和火箭等重型武器进行还击，双方爆发了激烈的枪战。美军的武装直升机也来助阵，向楼内发射了多枚导弹，使得这幢别墅和周围一处建筑几乎被完全摧毁。美军经过6个多小时的交火后才占领别墅。
美军士兵从别墅里拖出4具伊拉克人尸体，当时从尸体特征上已经可以辨认出乌代和库赛的身份，但为了谨慎起见，这几具尸体立刻被送往巴格达。
美军调查人员使用了多种方法对尸体进行了身份鉴定，最终证实乌代和库赛已经死亡。
实际上，在战争爆发前，美国就设法获取了萨达姆和他两个儿子的DNA样本，以便在战争中确认这3名关键人物的生死。4具尸体中，除乌代和库赛外，还有一具看上去只有十几岁，有可能是库赛的儿子，另一具成年人的尸体可能是一名保镖。
萨达姆两个儿子被打死后，美军公开展示了其经整容的遗体。虽然有些伊拉克人和科威特人对此“欢欣鼓舞”，但也有不少人对美军大搞双重标准，疯狂践踏伊斯兰传统的做法感到无比愤怒。
同一天，五角大楼承认，萨达姆的安全总管可能陪伴着自己的主子，在美军部队前往提克里特搜查前24小时从容离开。据悉，美军获悉萨达姆新任安全总管藏身地点的情报后，对提克里特3座农庄展开了突袭。结果却发现，对手早在24小时前就已逃之夭夭。27日当天，还有一名美海军陆战队士兵在巴格达南部地区被手榴弹炸死，另外有一人受伤。这是美军在经历了开战以来“收获最大，也是最血腥的一周战斗”后，出现的最新伤亡事例，这也是在巴格达南部地区发生的为数不多的袭击美军事件。
白宫原来以为，在打死了萨达姆两个儿子后，伊拉克境内的袭击行动将会大幅度减少，可从实际情况看，当地人开始变本加厉地报复美国人。对此，美国防部副部长沃尔福维茨在接受记者采访时强调，袭击美军事件激增属于萨达姆死党的正常反应。同时，大量有价值的情报也如潮水般涌来，并帮助美军查获了660多枚便携式地对空导弹。因此，随着时间推移，萨达姆可依靠的人将越来越少。五角大楼表示，美军将一直追击萨达姆，但没有什么所谓的“杀萨时间表”。沃尔福维茨宣称，只要打死或者俘虏萨达姆，那么伊拉克境内的反美势力将不攻自破。
美国军方希望萨达姆儿子之死可以摧毁那些萨达姆支持者的意志，华盛顿方面认为对美军的攻击事件就是这些支持者所为。而自从5月1日起先后有44名美军受袭丧生。自从萨达姆的两个儿子被杀之后，大量的信息被提供给联军。奥地尔诺将军还指出，在过去1个月中，美军受到袭击的次数降低了50%。
为了抓获萨达姆，美军情报人员千方百计通过前伊拉克政权高官的家人和部族人接近同萨达姆关系密切的家庭成员，这样的关系越来越多，情报人员不断同这些人员谈话。美军对接近萨达姆家庭的5～10名成员进行了逐个审讯。2003年12月13日上午10时左右，美军从其中一个人的口中获得了有关萨达姆藏身之处的确切情报。情报显示，萨达姆就躲藏在距他的家乡提克里特大约15公里的达瓦尔镇，于是美军决定立即抓捕萨达姆。
提克里特位于伊拉克首都巴格达西北160公里处，是萨达姆的家乡，也是他的发迹地。1937年4月，萨达姆出生在提克里特附近奥贾村的一座土坯房中。萨达姆掌权后，先后把一些同乡安排在伊拉克党政军部门的重要职位上，提克里特也成为仅次于巴格达的政治中心，那里不仅有萨达姆的行宫，而且有专供阿拉伯复兴社会党高级领导人居住和休闲的农场和乡间度假村。
根据美军13日上午获得的情况，美军确定了在达瓦尔镇附近两处可能被萨达姆用于藏身的地点，并把它们分别命名为“狼獾一号”和“狼獾二号”。美军决定当晚趁着月色采取“红色黎明行动”，逮捕萨达姆。当晚6时左右，美军第4步兵师包括炮兵、空军和陆军士兵在内的600名官兵，在该师指挥官奥地尔诺少将的率领下，乘着夜色，迅速包围了萨达姆藏身的地点。
这已经是萨达姆第三次被所谓的“效忠者”出卖了。第一次被出卖，失去了首都巴格达，导致萨达姆王朝的覆灭，第二次被出卖，儿子、孙子被打死，这一次被出卖，萨达姆从伊拉克至高无上的总统成为阶下囚。
那么，是谁出卖了萨达姆呢？一种说法认为是萨达姆的一个亲戚出卖了他，另一种说法是萨达姆在黎巴嫩的“二姨太”沙米拉出卖了最爱他的老公，还有一种说法是库尔德人早已捕到等着美军去提。
然而，这一次指挥搜捕的带队上校詹姆斯·希基带着一个极为重要的知情人，他曾是萨达姆特别保镖组织中的显贵高官，是老萨的亲信，他知道萨达姆就在他的出生地附近藏身。
显然，美军对这一情报非常重视，当晚8时，600名全副武装的美军士兵展开了攻击行动。美军士兵们做好了最坏的打算，因为在抓捕萨达姆的两个儿子乌代和库赛时发生了激烈的枪战，双方对峙了好几个小时，美军在直升机的掩护下才占据上风，最终打死了乌代和库赛。
这次搜捕行动进行得异常顺利。开始时，士兵们在两个农场里只捉到了老萨的司机和厨师，而没有找到萨达姆本人。但提供情报的人坚持说，萨达姆就藏在这里。就在这时，一名细心的士兵偶然发现，在一间泥房附近的一堆泥土中露出一团线，泥土下面还有塑料制品的迹象。这名士兵叫来一个同伴铲除了泥土，发现下面的一张毯子，掀起毯子，发现了一个用聚苯乙烯塑料做成的类似马槽的白色物件，拔出这个塑料槽，就发现了萨达姆藏身的地洞，还听见里面有些声响。
这个地洞从外面看实在太简陋了，士兵们都没想到萨达姆会藏身其中。
按照美军的搜寻程序，士兵们正准备向地洞中投掷手榴弹，以清理目标时，底下突然伸出双手，并有人用英语说，“我是萨达姆，伊拉克的总统，我想进行谈判。”
此时的萨达姆头发凌乱，胡子拉碴，一脸茫然，全然没有了往日的威风。一开始美军士兵都怀疑眼前这个老人是否就是他们的头号敌人萨达姆。美军从萨达姆的藏身处缴获了75万美元、两支AK47步枪和一把手枪。据说，萨达姆被捕时坦然承认了自己的身份，表现得非常合作，还很健谈。
随后，美军对萨达姆进行了检查，发现萨达姆被捕时戴着假胡须。一名医生对他进行了体检，用舌压板把他的嘴撑开，提取了他的DNA样本。DNA测试表明，他的确是萨达姆。
出卖萨达姆的是他的亲戚穆罕默德·易卜拉欣·奥尔·穆斯利特将军。
他在12月13日将萨达姆麻醉，然后向美军告密。但是，他不可能从美军那里得到任何好处，因为美国人已认定他是个坏蛋，不但得不到2500万美元的赏金，还要将他投进监狱。
萨达姆被捕，结束了8个月的逃亡生活。其实，逃亡生活对萨达姆来说并不陌生。1959年时年仅22岁的萨达姆就因刺杀当时的伊拉克领导人失败而逃亡过。然而，44年后他在登上权力最高峰后再一次逃亡，并且是一次没有希望的逃亡。
