1997年9月，党的十五大报告指出：“公有制为主体、多种所有制经济共同发展，是社会主义初级阶段的一项基本经济制度”，“非公有制经济是我国社会主义市场经济的重要组成部分。对个体、私营等非公有制经济要继续鼓励、引导，使之健康发展”。
11月，国家工商行政管理局会同公安部、国家税务总局联合下发了《关于对无照经营进行综合治理的通知》，专门成立了由有关部门参加的无照经营综合治理工作小组，在全国范围内对无照经营进行了清理和取缔。据不完全统计，全国共清理了无照经营户130多万户。
1998年4月，中共中央、国务院发出的《关于进一步扩大对外开放、提高利用外资水平的若干意见》指出，鼓励国有大中型企业采取多种方式利用外资进行资产重组。制定和完善有关法律、法规，允许国有小型企业和集体企业对外合资、合作、出售。允许私营企业吸收外资发展经济。
1999年3月15日，九届全国人大二次会议通过的《中华人民共和国宪法修正案》规定：“在法律规定范围内的个体经济、私营经济等非公有制经济，是社会主义市场经济的重要组成部分。”“国家保护个体经济、私营经济的合法的权利和利益。国家对个体经济、私营经济实行引导、监督和管理。”
2000年1月1日，《个人独资企业法》实施。
1月25日，国务院决定，从2000年1月1日起，对设在中西部地区的国家鼓励类外商投资企业，实行新的优惠政策。
3月22日，为鼓励外商扩大对华投资，国家计委和国家经贸委发出通知，下放对《外商投资产业指导目录》鼓励类中不需要国家综合平衡的外商投资项目审批权。
9月7日，国务院办公厅转发国家经贸委《关于鼓励和促进中小企业发展的若干政策意见》。
12月19日，外经贸部发布通知，决定自2001年1月1日起，对私营生产企业和科研院所申请自营进出口权的资格条件按国有、集体生产企业和科研院所的同等标准执行。
2001年4月，国家工商行政管理总局与国家经贸委、科技部等十部委联合下发了《关于加强中小企业信用管理工作的若干意见》，标志着我国中小企业信用体系建设开始起步。
8月，经国务院批准，国家工商行政管理总局外商投资企业注册局成立。
11月10日，在卡塔尔多哈举行的世界贸易组织（WTO）第四届部长级会议通过了中国加入世界贸易组织法律文件。12月11日，中国正式加入世界贸易组织，成为其第一百四十三个成员。
2002年4月，由国家工商行政管理总局外商投资企业注册局主办的中国外资登记网正式开通，有力促进了外资管理工作信息化、自动化水平的提高。
10月，国家工商行政管理总局下发了《关于贯彻落实〈中共中央国务院关于进一步做好下岗失业人员再就业工作的通知〉的通知》，要求各级工商行政管理机关积极促进下岗失业人员再就业，对从事个体经营的下岗失业人员，3年内免收个体工商户登记费、个体工商户管理费、集贸市场管理费、经济合同鉴证费和经济合同文本工本费；对下岗失业人员凭再就业优惠证申办个体工商户和私营企业的，优先受理，优先发照。
11月，党的十六大报告指出：“坚持和完善公有制为主体、多种所有制经济共同发展的基本经济制度。第一，必须毫不动摇地巩固和发展公有制经济。
第二，必须毫不动摇地鼓励、支持和引导非公有制经济发展。个体、私营等各种形式的非公有制经济是社会主义市场经济的重要组成部分，对充分调动社会各方面积极性、加快生产力发展具有重要作用。第三，坚持公有制为主体，促进非公有制经济发展，统一于社会主义现代化建设的进程中，不能把这两者对立起来。”党的十六大还通过了私营企业的经营者可以加入中国共产党的决议，使得私营企业家的政治地位进一步提高。
2003年3月1日，国务院制定的《无照经营查处取缔办法》实施。
6月29日，内地与香港签订《内地与香港关于建立更紧密经贸关系的安排》。据此，从2004年1月1日起，内地对原产于香港的273种产品实行零关税优惠，允许香港永久性居民中的中国公民在广东省境内申办个体工商户，从事商业零售。
9月1日，《民办教育促进法》正式实施。
10月，党的十六届三中全会审议通过的《中共中央关于完善社会主义市场经济体制若干问题的决定》指出：“要适应经济市场化不断发展的趋势，进一步增强公有制经济的活力，大力发展国有资本、集体资本和非公有资本等参股的混合所有制经济，实现投资主体多元化，使股份制成为公有制的主要实现形式。”《决定》要求，大力发展和积极引导非公有制经济，放宽市场准入，允许非公有资本进入法律法规未禁入的基础设施、公用事业及其他行业和领域。
10月17日，《内地与澳门关于建立更紧密经贸关系的安排》在澳门签署。
2004年3月14日，十届全国人大二次会议通过的《中华人民共和国宪法修正案》规定：“国家保护个体经济、私营经济等非公有制经济的合法的权利和利益。国家鼓励、支持和引导非公有制经济的发展，并对非公有制经济依法实行监督和管理。”与此同时，“公民的合法的私有财产不受侵犯”等内容被写入宪法，进一步完善了私有财产保护制度。
8月，国家工商行政管理总局和国家人事部正式发文批准在上海开展注册官制度试点工作。11月14日，我国首批280名企业注册官在上海诞生，开始正式履行职责。
10月，经国务院批准，内地与香港、澳门分别签署了《关于建立更紧密经贸关系的补充协议》。《补充协议》规定，自2005年1月1日起，允许香港、澳门永久性居民中的中国公民依照内地有关法律、法规和行政规章，在内地各省、自治区、直辖市设立个体工商户，无须经过外资部门审批。
12月24日，100名非公有制经济人士在北京接受中共中央统战部等五部委的联合表彰，被授予“中国特色社会主义事业优秀建设者”称号。这是我国首次对为改革开放和社会主义现代化建设作出贡献的非公有制经济人士进行表彰。
2005年2月，国务院公布的《关于鼓励支持和引导个体私营等非公有制经济发展的若干意见》明确提出，放宽非公有制经济市场准入，加大对非公有制经济的财税金融支持，完善对非公有制经济的社会服务，维护非公有制企业和职工的合法权益，引导非公有制企业提高自身素质，改进政府对非公有制企业的监管，加强对发展非公有制经济的指导和政策协调。这是改革开放以来，我国最全面、最系统的关于促进非公有制经济发展的政策性文件。
3月11日，中国民航第一家私营航空运输企业奥凯航空公司开通首次航班。
5月1日，全国劳模和先进工作者表彰大会召开，33位私营企业主首次被选为全国劳模。在此之前，私营企业主能否当选劳模一直是社会各界争论的焦点。
6月29日，首家全国性私营石油企业长联石油控股公司在北京正式成立。
该公司由湖北天发集团联合全国30家私营石油企业共同参股成立。这是我国私营石油企业从单打独斗走向联合的一个有益尝试。
2006年1月，中共中央、国务院发出《关于深化文化体制改革的若干意见》，首次允许转制为企业的文化单位吸收部分社会资本，进行投资主体多元化的股份制改革。这为非公资本投资文化产业带来了更多机会。针对欧盟从2006年10月7日起正式对原产于中国的皮鞋产品征收为期两年的16.5％的反倾销税，在我国1200多家涉案企业集体沉默的情况下，10月23日，奥康集团聘请律师，决定状告欧盟的行为违反欧盟相关法律，誓将反倾销申诉进行到底，使我们看到了我国私营企业在国际贸易中勇于依法维权的希望。
2007年2月27日，国防科工委下发《关于非公有制经济参与国防科技工业建设的指导意见》，对非公有制经济进入国防科技工业建设的领域、程度、要求等提出了十一条具体措施，打开了非公有制企业参与国防科技工业建设的大门。
3月1日挂牌开业的四川省仪陇县惠民村镇银行，是我国首家村镇银行。
同年12月在湖北省随州市开业的汇丰村镇银行，是在我国设立的第一家外资农村金融机构。
3月16日，第十届全国人民代表大会第五次会议审议通过了《物权法》和《企业所得税法》。《物权法》保护包括个人在内的所有物权人的合法物权，这使私营企业能够更加放心地去创造财富，为社会主义市场经济贡献力量。《企业所得税法》结束了不合理的外资“超国民待遇”，为内外资企业提供了同一条起跑线，让内资企业从原先的高税赋中解脱出来，集中精力投入产品研发，提高市场竞争力。
10月，党的十七大报告指出，毫不动摇地巩固和发展公有制经济，毫不动摇地鼓励、支持、引导非公有制经济发展，坚持平等保护物权，形成各种所有制经济平等竞争、相互促进新格局。法律上的平等保护和经济上的平等竞争，这“两个平等”是十七大在所有制理论上的重大突破，是非公有制经济理论的又一次飞跃。
2008年，经国务院批准，全国工商行政管理系统从9月1日起停止征收个体工商户管理费和集贸市场管理费。对此，个体工商户普遍表示欢迎。社会各界盛赞这是我国社会治理方式向更加符合社会发展方向转变的重要变革。
