在中医药学中，大蒜始载于汉末的《名医别录》。宋代《图经本草》说：
“葫，大蒜也。今处处有之，人家园圃所莳也。”明代李时珍的《本草纲目》说：“葫蒜……王祯称之云：味久不变，可以资生，可以致远，化臭腐为神奇，调鼎俎，代醯酱，携之旅途，则炎风瘴雨不能加，能（音àI。食物败坏变味）腊毒不能害，夏月食之解暑气，北方食肉面，尤不可无，乃《食经》之上品，日用之多助者也。”故自古备受重视。
《本草纲目》还引用了多则病例以证实大蒜治疗疾病的神奇功效：有一位妇女，鼻出血一昼夜不止，用诸般药物治疗皆无效。李时珍嘱其用大蒜捣烂，敷在足心涌泉穴处，出血很快就止住了。
青蒜
《本草纲目》又引叶石林《避暑录》载：有仆人暑热天气驰马于烈日之下，突因中暑昏倒。当时王相正好遇上，他叫路边的人取来大蒜和道路上的热土各一大把，以井水一碗拌和，再滤出药汁，紧接着掰开病人的嘴灌下，不到一会儿功夫病人就苏醒了。
大蒜外敷还能治痈疽疮毒。据《本草纲目》载：唐时，有一个叫卢坦的侍郎，肩膀生了一个疮肿，连心痛闷，医生用独头蒜两颗，捣烂如泥，用麻油调和，厚厚地敷在疮上，干了就换药，终于肿消痛止。后来，李仆射患脑痈，许久不愈，卢坦把这方子传他，用后也痊愈了。李时珍将大蒜内服称之为“内灸”。书中记载：古时曾有一人患痃癖证，腹内有条索结节样肿块，久不能愈。有一天，病人在夜间梦见一个仙人，叫他每日食大蒜三颗。初服时人感到眩晕欲睡，呕吐呃逆，下腹部灼热如火。后来有人指点他取蒜数瓣，连皮切成头尾两段吞服，并说这是“内灸”法，如法用之，果然效果显著。《本草纲目》还有多则用隔蒜灸法治疮疡的病案，说明大蒜灸能“发泄毒气”。
近年出版的《饮食养生全方略》说大蒜有八大功效：①温中行滞，有“温补宣通”之功；②健胃祛痰，“健脾胃”还有祛痰止咳之功；③抗痨益肺，“治吐血心痛”；④护肝良药，有保护肝脏之良效；⑤降压降脂，“下气，消谷，化肉”；⑥抗菌消炎，“杀毒气”，“治泄泻暴痢及干湿霍乱”；⑦解毒杀虫，有抗抑疟原虫作用；还可“去蛊毒”，治血吸虫引起的肝脾肿大等症；捣烂外贴，又可治“恶疮、蛇虫、溪毒、沙虱”诸疾；⑧预防癌症。这些功效都是根据《纲目》整理归纳的。
大蒜生食或熟食有暖脾肾，行气化滞，温化冷积的作用。故《日华子本草》说它有“宣通温补”之功。《随息居饮食谱》指出：大蒜“生用辛热，熟者甘温，除寒湿，辟阴邪，下气暖中，消谷化肉……攻冷积，治暴泻腹痛……辟秽解毒，消痞杀虫。”可代表前人对其性能的一般解说。
