大蒜自古就被当作天然杀菌剂，有“天然抗生素”之称。它没有任何副作用，是人体循环及神经系统的天然强健剂。数千年来，中国、埃及、印度等国将大蒜既作为食物也作为传统药物应用。在美国，大蒜素制剂已排在人参、银杏等保健药物中的首位，它的保健功能可谓妇孺皆知。但在实际生活中，由于大蒜的气味具刺激性和因人而异的口味及饮食习惯，许多人日常摄入的大蒜素微乎其微。
早在1858年，微生物学家路易巴斯德就发现了大蒜的抗菌作用；1954年，苏联医学家研究证实，大蒜汁能在3分钟内杀灭培养基内的细菌。近代研究证实，蒜油（葫油）可以消灭多种真菌和酵母菌，调整肠寄生菌，有排毒作用，大蒜化合物蒜素也已证实是强效的抗生素，对痢疾杆菌、大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、结核杆菌、脑膜炎双球菌、白喉杆菌等有抑制作用。大蒜对于霍乱的治疗效果也早在1758年就已经被记载。
大蒜挥发油所含大蒜辣素等还具有明显的抗炎灭菌作用，尤其对上呼吸道和消化道感染、真菌性角膜炎、隐孢子菌感染有显著的功效。
大蒜能抗痨益肺，研究表明有抗结核杆菌作用，用大蒜粥治疗肺结核有一定效果。制法：取紫皮大蒜约30克，去皮，将蒜放入沸水中煮1～3分钟后捞出，然后取秫米50克，放入煮蒜水中煮成稀粥，待粥已成，再将大蒜捣碎重新搅入粥中，即可食用。
口服大蒜浸剂可用于治疗小儿真菌性肺炎。用法：生大蒜6～9克，冷开水洗净，捣碎，冲入沸水60毫升，浸泡1小时，去渣，分3次口服（此为1岁小儿1日剂量，其他年龄可酌情增减）。用此法治疗，一般均可在7～18天痊愈。
大蒜中含有一种叫“硫化丙烯”的辣素，对病原菌和寄生虫都有良好的杀灭作用，可预防感冒，减轻发热、咳嗽、喉痛及鼻塞等感冒症状。
印度医学的创始人查拉克说：“大蒜除了讨厌的气味之外，其实际价值比黄金还高。”俄罗斯医学家称“大蒜是土里长出的盘尼西林（青霉素）。”
